Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTDSPL2Q05D32 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTDSPL2Q05D32 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms