Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC131097.1-201ENST00000437438 739 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 RASA2-IT1-201ENST00000507770 612 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TNP2Q05952 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms