Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLOD1Q02809 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms