Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DSG1Q02413 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms