Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC6A3Q01959 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms