Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAP1Q01518 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms