Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDC42EP1Q00587 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms