Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK16Q00536 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms