Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPCS3P61009 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms