Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVPABLB-1P60509 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVPABLB-1P60509 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms