Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms