Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCN1P48444 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms