Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC1A2P43004 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms