Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ACTN2P35609 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms