Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA7P31268 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms