Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCSK6P29122 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCSK6P29122 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCSK6P29122 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCSK6P29122 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCSK6P29122 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCSK6P29122 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCSK6P29122 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms