Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2E1P29083 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GTF2E1P29083 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms