Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms