Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YY1P25490 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YY1P25490 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
YY1P25490 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
YY1P25490 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
YY1P25490 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms