Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1P23471 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms