Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPRGP23470 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRGP23470 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
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