Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPREP23469 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPREP23469 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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