Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CALB2P22676 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CALB2P22676 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CALB2P22676 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CALB2P22676 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CALB2P22676 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CALB2P22676 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CALB2P22676 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms