Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USF1P22415 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF1P22415 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF1P22415 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF1P22415 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF1P22415 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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