Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACADSP16219 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACADSP16219 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACADSP16219 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACADSP16219 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSP16219 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSP16219 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSP16219 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSP16219 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACADSP16219 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms