Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME1P15531 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME1P15531 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME1P15531 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms