Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-EP13747 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms