Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFP01375 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFP01375 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFP01375 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFP01375 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms