Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VIPP01282 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VIPP01282 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VIPP01282 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VIPP01282 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VIPP01282 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms