Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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CLDN9O95484 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN9O95484 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN9O95484 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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