Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL2O95198 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL2O95198 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms