Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms