Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms