Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NPHP4O75161 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms