Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCO2O43819 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCO2O43819 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCO2O43819 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms