Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFSF14O43557 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNFSF14O43557 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms