Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COCHO43405 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COCHO43405 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COCHO43405 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COCHO43405 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms