Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H3BNH8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H3BNH8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms