Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
WASHC1A8K0Z3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms