Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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