Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TPRKBQ9Y3C4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TPRKBQ9Y3C4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms