Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SETD1BQ9UPS6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SETD1BQ9UPS6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms