Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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USP18Q9UMW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP18Q9UMW8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP18Q9UMW8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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