Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDM5BQ9UGL1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms