Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK3Q9UBP4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms