Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCMF1Q9P0J7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms