Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHST12Q9NRB3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms