Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFDN4Q9NQP4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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