Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FANCFQ9NPI8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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