Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APOBEC3GQ9HC16 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms